Для деплоя приложений на nodejs есть пара инструментов, таких как shipit и flightplan. Оба они не так хороши, как capistrano для ruby или deployer для php, но если для деплоя хочется выбирать ту же экосистему, что и для разработки, то выбирать особо не приходится.

Если сравнивать shipit и flightplan, то можно сказать, что первый - более модульный, имеет некоторые плагины, а также поддерживает функцию "rolling releases", второй же - более простой и понятный.

На сервере, да и локально, я использую nvm для переключения между версиями nodejs и здесь я столкнулся с проблемой.

Недавно подготовил презентацию на тему деплоймента php-приложений. Сделал обзор основных проблем при делое, а также обзор способов их решение и инструментов, которые можно использовать для деплоя, благо PHP идет по следам Ruby и появляются различниые инструменты для этого, такие как Rocketeer.

С моей презентацией можно познакомиться перейдя по этой ссылке (навигация идет не только влево-вправо, но и вверх-вниз).